Keiko Fujimori tốt nghiệp Trường Công giáo Peru Colegio Sagrados Corazones Recoleta (Recoleta Academy of the Sacred Hearts) vào năm 1992; các anh chị em của cô Kenji, Hiro và Sachi đều theo học tại Recoleta.[5] Năm tiếp theo, cô tới Hoa Kỳ để theo đuổi tấm bằng Cử nhân chuyên ngành Quản trị Kinh doanh. Cô bắt đầu học tại Đại học Stony Brook, và tốt nghiệp năm 1997 từ Đại học Boston.[cần dẫn nguồn] Cô nhận được tấm bằng M.B.A. từ Columbia Business School vào năm 2006.[cần dẫn nguồn]